Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp4Q60972 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms