Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurod1Q60867 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod1Q60867 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms