Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a4Q60857 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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