Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf3Q60803 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms