Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema5bQ60519 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms