Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tsr1Q5SWD9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms