Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bbs12Q5SUD9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms