Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms