Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf215Q5SPX3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf215Q5SPX3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms