Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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