Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fam208bQ5DTT3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms