Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf608Q56A10 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf608Q56A10 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms