Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spire1Q52KF3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms