Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syne3Q4FZC9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syne3Q4FZC9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms