Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt35Q497I4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt35Q497I4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms