Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc185Q3V118 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms