Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Lrrc43Q3V0L5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Lrrc43Q3V0L5 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Lrrc43Q3V0L5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Lrrc43Q3V0L5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Lrrc43Q3V0L5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Lrrc43Q3V0L5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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Lrrc43Q3V0L5 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc43Q3V0L5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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