Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930596D02RikQ3V0H9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms