Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp48Q3V0C5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp48Q3V0C5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp48Q3V0C5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp48Q3V0C5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp48Q3V0C5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Usp48Q3V0C5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp48Q3V0C5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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