Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E330034G19RikQ3UWX6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms