Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pfdn4Q3UWL8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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