Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf223Q3UV31 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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