Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim15Q3UTD9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms