Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm28047Q3US59 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm28047Q3US59 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms