Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TceancQ3US16 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TceancQ3US16 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms