Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem253Q3UNB8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms