Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cog7Q3UM29 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog7Q3UM29 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms