Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms