Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxosQ3UL53 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CrxosQ3UL53 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms