Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rmdn3Q3UJU9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms