Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp19Q3UJD6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp19Q3UJD6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms