Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc34Q3UI66 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc34Q3UI66 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms