Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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