Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Lrrc58Q3UGP9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrrc58Q3UGP9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc58Q3UGP9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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