Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pid1Q3UBG2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms