Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q3U6N9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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