Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ulk3Q3U3Q1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ulk3Q3U3Q1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms