Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf40Q3U319 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf40Q3U319 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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