Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sec24aQ3U2P1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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