Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam193bQ3U2K0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam193bQ3U2K0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms