Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q3U1D9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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