Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms