Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms