Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccndbp1Q3TVC7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccndbp1Q3TVC7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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