Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shcbp1lQ3TTP0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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