Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Prr27Q3SYJ2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms