Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtl9Q32KG4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtl9Q32KG4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms