Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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Shroom4Q1W617 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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Shroom4Q1W617 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shroom4Q1W617 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shroom4Q1W617 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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