Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm1123Q1RME4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms