Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms